El área de Conservación del museo vela diariamente por el bienestar integral de la colección, y de manera coordinada dedica sus esfuerzos a preservar cada una de las piezas patrimoniales que la componen, conforme a los estándares internacionales que rigen el ámbito museológico.
El acervo del museo se almacena en la Reserva Técnica, espacio de monitoreo permanente, donde se llevan adelante los procesos de acondicionamiento para las exhibiciones. Cada movimiento es documentado como parte de la historia de los objetos, información que queda a disposición en formato digital para uso de las áreas de Investigación y Curaduría.
Para frenar los deterioros que ocasiona el paso del tiempo y las condiciones medioambientales, el museo cuenta además con su propio taller de Restauración, donde profesionales calificados realizan las intervenciones materiales necesarias para devolverle calidad estructural a las obras que así lo requieren.
